MATARAM INSIDE

Indonesia – Dapatkan berita terbaru tentang Indonesia. Baca Breaking News on Indonesia diperbarui dan diterbitkan di Maratam Inside

Belgia meletakkan dasar bagi perusahaan teknologi DNA bernilai miliaran dolar

Penemuan di laboratorium Brussel adalah dasar untuk teknik baru yang dapat diterapkan secara luas untuk membaca DNA. “Ini mungkin membawa penelitian medis ke tingkat lain dan meluncurkan gelombang baru terobosan dalam kanker dan penyakit otak.”

Perusahaan Inggris Oxford Nanopore Technologies (ONT) menyebabkan kegemparan dalam industri bioteknologi. Dalam putaran modal bulan lalu, nilainya mencapai £2,5 miliar. Sejak awal, investor telah menginvestasikan lebih dari setengah miliar di ONT. Sekarang ONT berada di garis lurus terakhir untuk listing di London Stock Exchange.

Perusahaan AS Illumina – dengan kapitalisasi pasar lebih dari $50 miliar – adalah (masih) pemimpin yang tak terbantahkan di pasar untuk peralatan pembacaan DNA, pembawa karakteristik genetik. Urutan terminologi. Tapi ONT menyerang dominasi itu.

intinya

Oxford Nanopore Technologies (ONT) telah mengembangkan metode baru untuk membaca DNA. Itu memungkinkan untuk mempelajari perubahan genetik secara lebih rinci dan memberikan penelitian tentang kanker, penyakit otak dan mikrobioma dorongan ekstra.
Di jantung perangkat ONT adalah teknologi, yang fondasinya telah diletakkan oleh Han Remaut, seorang peneliti di VIB (Flemish Institute of Biotechnology).
ONT menyerang dominasi perusahaan AS Illumina, yang bernilai 2,7 miliar pound dalam putaran modal baru-baru ini.

Fakta bahwa raksasa farmasi AS Amgen adalah pemegang saham mengatakan banyak hal. ONT memberikan gambaran sekilas tentang bagian genom yang sebelumnya tidak dapat diakses. Ini memberikan wawasan baru yang dapat berguna di banyak bidang penyakit, dan itulah motivasi Amgen pada saat itu.

Pengurutan DNA adalah teknologi penting dalam sains modern. “Mereka membentuk dasar dari terobosan besar dalam dekade terakhir,” kata Toon Swings dari tim Flanders Institute of Biotechnology (VIB) Tech Watch.


Di Antwerpen, teknologi ONT digunakan untuk menemukan tanda-tanda penyakit otak sejak dini. di Leuven untuk lebih memetakan hubungan antara bakteri usus dan penyakit.

Urutan telah menyebabkan, antara lain, percepatan yang belum pernah terjadi sebelumnya dalam pengembangan terapi kanker yang disesuaikan dengan profil genetik pasien. Ini juga mengarah pada identifikasi ribuan penyakit genetik baru, kesadaran bahwa flora usus mungkin memainkan peran penting dalam penyakit seperti obesitas atau Alzheimer, dan melihat sekilas karakteristik virus corona.

Di dunia tanaman juga, Anda sekarang dapat melakukan lebih banyak hal untuk membuatnya tahan kekeringan, misalnya. Hanya ketika Anda memiliki wawasan tentang DNA sel manusia, hewan atau tumbuhan, Anda dapat mulai menggunakannya, kata Swings.

Proyek Kode Genetik Manusia

Semakin akurat, cepat dan murah kita dapat membaca DNA, semakin baik. Dua puluh tahun yang lalu, seluruh genom manusia pertama kali dipetakan. Proyek ini – Proyek Genom Manusia – telah menelan biaya beberapa miliar dolar dan waktu beberapa tahun. Sekarang, berkat Illumina, antara lain, hanya butuh dua hari dan $1.000 untuk ini.

Teknologi ONT memiliki potensi untuk membawa penelitian ke tingkat berikutnya. Saya pikir kita berada di awal gelombang baru jerawat, kata Swings.

Keakuratan teknologi ONT belum mencapai 100%, namun ada kelebihan lain. Dengan teknologi konvensional, ia akan selalu membaca dan menganalisis potongan-potongan pendek DNA. Dengan ONT, Anda dapat membaca lebih dari 100.000 karakter, bukan 150 karakter sekaligus, sehingga Anda juga dapat menangkap perubahan struktural DNA yang signifikan. Anda kemudian dapat melihat DNA dan mutasi dengan cara yang sama sekali berbeda.

Di Antwerpen, ONT digunakan untuk menemukan sinyal penyakit otak pada tahap yang sangat awal. Di Leuven mereka menggunakannya untuk memetakan hubungan antara bakteri usus dan penyakit dengan lebih baik. Kami sekarang dapat mendeteksi bakteri yang ada dalam jumlah kecil. Dengan alat yang akurat, Anda dapat melakukan penelitian yang lebih baik dan Anda akan mendapatkan pemahaman yang lebih baik tentang proses penyakit’, ia membaca.

Paus bungkuk

Selain itu, Anda dapat meminimalkan teknologi ONT. “Versi yang lebih kecil adalah semacam stik USB. Anda mencolokkannya ke komputer Anda dan mengunggah sampel dan mengurutkannya. Ada peneliti di VIB yang mereka bawa, terkadang untuk melihat sesuatu hanya untuk bersenang-senang, untuk melihat apa yang ada di kopi. ,” kata Swings.

Bahkan ONT terbesar hanya berukuran 50 x 60 cm, yang jauh lebih kecil dari saingannya Illumina. “Ini memungkinkannya untuk digunakan di mana saja, bahkan di tempat yang paling terpencil.”


Dengan ONT, Anda dapat membaca 100.000 karakter DNA, bukan 150 sekaligus. Anda kemudian dapat melihat DNA dan mutasi dengan cara yang sama sekali berbeda.

ayunan toon

Institut Bioteknologi Flemish (VIB)

Misalnya, ONT digunakan di lautan untuk menganalisis “ingus” paus bungkuk yang dikumpulkan oleh drone di atas lubang tiupan hewan tersebut. Hal ini berguna untuk memantau kesehatan penduduk dan mengukur dampak perubahan iklim. Aplikasi potensial lainnya adalah menyaring air minum di desa-desa terpencil di Afrika secara teratur untuk keberadaan DNA patogen seperti Ebola atau kolera (baca sisipan).

ONT telah mengerjakan teknologinya sejak 2005, tetapi baru meningkatkan peralatannya dalam beberapa tahun terakhir. Terima kasih kepada para peneliti Belgia di Pusat Biologi Struktural, bagian dari VIB. Laboratorium yang sama sebelumnya meletakkan dasar bagi perusahaan biotek Ablynx, Confo Therapeutics dan Biotalys ketika sistem kekebalan llama hancur.

Vorser Han Remaut menemukan sebuah penemuan di Brussel ketika dia sedang mencari bakteri E.coli. Ternyata menggunakan protein dengan pori-pori membran tertentu yang bisa berguna untuk penelitian DNA.

Itu diambil oleh Nature pada tahun 2014. Ini telah menghasilkan minat di seluruh dunia, kolaborasi dengan Oxford Nanopore dan kemajuan dalam pengurutan nanopore. Yang terakhir adalah cara baru, kuat dan inovatif untuk membaca DNA. Pori-pori protein tertanam di perangkat. Untaian DNA didorong melalui pori-pori itu – semacam saluran. Setiap kali sepotong DNA baru melewatinya, bentuk pori-porinya sedikit berubah. Perubahan bentuk ini diubah menjadi sinyal listrik berbeda yang dibaca mesin. Misalnya, sebuah mesin membaca DNA huruf demi huruf.

Ini memberi kami pengetahuan biologis dan memaketkan paten bersama. Semua yang dijual ONT mengandung VIB. Jika bukan karena kami, ini akan menjadi cerita yang sama sekali berbeda,” kata Jerome van Beervelt, Direktur VIB.

Van Biervliet tidak menyesal VIB tidak membuat acara sendiri dengan teknologi. “Mereka menyusun teka-teki dan kami memiliki potongannya. Terkadang Anda harus mengumpulkan pengetahuan untuk menghasilkan sesuatu yang unik. Itu tidak berhasil.”

Di semak-semak dengan mesin DNA

Sebuah tim dari VIB sedang menyelidiki kemungkinan menggunakan MinION, perangkat ONT, untuk membuat ‘klinik air bergerak’ di Afrika.
Rencananya adalah untuk secara teratur memeriksa kualitas air di sumur di lokasi terpencil dengan mengisolasi DNA dalam sampel air dan memeriksa DNA untuk patogen seperti Ebola, difteri, salmonella dan kolera.
“Ini adalah perangkat kecil, tidak lebih besar dari smartphone. Anda dapat membawanya, menghubungkannya ke komputer dan membaca DNA, di mana saja di dunia. Sebaliknya, tidak mudah untuk menjamin kualitas penelitian. sampel jika Anda harus mengangkutnya melalui semak-semak sejauh ratusan kilometer ke laboratorium, seperti kata ahli biologi molekuler Mark Hyde, yang membantu mendirikan proyek tersebut.

READ  Saya ditanya pertanyaan apakah Anda pingsan?